Nace como un organismo Público Descentralizado de la Administración Pública del Estado de Chiapas con personalidad Jurídica y patrimonio propios en diciembre de 2004; inicia sus operaciones académicas en el año 2005, en la ciudad de San Cristóbal de Las Casas. Se crea con la finalidad de impartir enseñanza de alta calidad, fomentar la investigación y difundir sus resultados de acuerdo a las necesidades de la población indígena; así lo marca el Decreto de creación de la UNICH que a la letra dice: "Esta universidad integra la cosmovisión de los mazahuas, otomíes, matlazincas, náhuas y tlahuicas con la clara intención de preservar el patrimonio cultural de estos pueblos indígenas".
La UNICH se ubica en San Cristobal de las casas y cuenta con cuatro Unidades académicas en los municipios de: Oxchuc, Margaritas, Valle del Tulijá y Yajalón. Atiende principalmente a los demandantes de 13 lenguas (Tseltal, Tsotsil, Chol, Zoque, Tojolabal, Zapoteco, Mame, Akateco, Kanjobal, Chuj, Mixteco, Mazateco y Maya). Este grupo de lenguas son las que aparecen en SEP-CGEIB (2015). Coordinación General de Educación Intercultural y Bilingüe. Dirección de Educación Media Superior y Superior. Matrícula total de las Universidades Interculturales (Ciclo Escolar 2015-2016). SEP-CGEIB, Octubre 2015.
El postulado de la UNICH referente a la inclusión de los alumnos consiste en ampliar y diversificar las oportunidades de acceso a la educación superior y acercar la oferta educativa a la población indígena, así lo marca el Decreto de creación: "(…) se crea la Universidad Intercultural, para ofrecer opciones de educación superior que sean pertinentes a las necesidades de desarrollo de los pueblos indígenas (...) La Universidad Intercultural, contribuirá a ampliar la oferta educativa a los egresados del nivel medio superior, tanto a los integrantes de las comunidades indígenas, como aquellos que están interesados en los programas educativos que ésta oferte”.
La Universidad Intercultural de Chiapas es una Institución de Educación Superior Pública y Descentralizada del Gobierno del Estado, que sobre la base del modelo educativo intercultural forma profesionistas de calidad, con valores, compromiso social y dominio de lenguas originarias de la entidad, a partir de la integración de conocimientos de los pueblos originarios y científicos para contribuir a la construcción de una sociedad con mejor calidad de vida (Página Web UNICH).
En el año 2018, la UNICH es una institución líder en la educación intercultural en el país con amplio reconocimiento social. Posee una planta académica-administrativa certificada y estudiantes con formación integral y competencias para la autogestión y acceso al mercado laboral. Cuenta con infraestructura y equipo suficiente para operar los programas educativos, así mismo la gestión institucional se orienta con sistemas de planeación y administración certificados (Página Web UNICH).
Las licenciaturas que imparte esta Universidad de acuerdo a la Base de datos de las Universidades interculturales, que se integra con la información del formato 911.9A son:
• Licenciatura en Comunicación intercultural
• Licenciatura en Desarrollo intercultural
• licenciatura en Desarrollo sustentable
• Licenciatura en Lengua y cultura
• Licenciatura en Medicina intercultural
• Licenciatura en Turismo alternativo
Los indicadores educativos de la UNICH referidos al Nuevo ingreso, Matrícula, Egresados, Titulados y Abandono escolar a partir del ciclo 2006-2007 hasta el 2015-2016 se presentan por medio de gráficas que muestran información global y desglosada por ciclo escolar, sexo, campo amplio y carrera. Lo anterior permite tener un acercamiento a la situación educativa de esta universidad y al mismo tiempo, ofrece condiciones de posibilidad para profundizar en ello a partir de los datos oficiales consignados por ella misma; los cuales forman parte de la Base de datos de las Universidades Interculturales que se encuentra disponible en este mismo sitio Web.